TÉLÉCHARGER MOLÉCULE ARN RASTOP

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Préambule 1. Le problème majeur posé par l'enseignement des structures enzymatiques est la perception des objets dans l'espace à 3 dimensions. Pour les molécules de faibles tailles rencontrées surtout en chimie, on utilise en travaux pratiques des modèles moléculaires de plastique ou de bois qui facilitent la compréhension de la stéréochimie des molécules. Ces modèles deviennent difficiles à utiliser pour l'illustration des structures et des mouvements des macromolécules comme les enzymes et les protéines. Plus de détails sur les structures moléculaires étudiées par Rastop.

Nom: molécule arn rastop
Format:Fichier D’archive
Version:Nouvelle
Licence:Libre!
Système d’exploitation: iOS. Windows XP/7/10. MacOS. Android.
Taille:18.34 MB

Plus de détails sur les structures moléculaires étudiées par Rastop. Dans le projet de l'étude de la relation structure-fonction, chaque étudiant choisira la protéine qu'il désire étudier à l'aide du programme RasTop. En exploitant les connaissances de base sur la protéine, il préparera un compte-rendu de pages décrivant en détail la structure de la molécule.

Un index contenant au moins images RasTop peut être joint au compte-rendu. Joindre au compte-rendu une copie des informations de base sur la molécule sujet d'étude ainsi que des références bibliographiques.

Les molécules 3D

Nous privilégierons Jmol , disponible à la fois sous forme d'application indépendante et d'applet pour navigateur, ce qui à l'avantage de la cohérence. De plus ce logiciel basé sur Java fonctionne sur tous les systèmes d'exploitation l'installation du jre est nécessaire ; une nouvelle version Javascript de l'applet permet même de se passer de Java.

Rasmol , a beaucoup vieilli. Cn3d au contraire bénéfie d'un développement actif.

Presque toutes les applications citées sont libres. Une troisième version est apparue récement sous forme d'un applet Javascript. Ce programme reprend le langage de commande de Rasmol. La vitesse d'affichage est très rapide surtout pour un programme en Java.

Utiliser, modifier et créer des scripts pour « RASTOP »

Comme pour Rasmol dont il s'inspire, il existe deux méthodes de travail pour afficher les molécules, l'une intuitive mais limitée faisant appel aux menus, l'autre en ligne de commande la fenêtre de la console est nommée Rasmol scripts.

La visualisation en ligne de molécules évolue avec le temps; dans un passé déjà lointain il fallait installer un module spécifique dans son navigateur.

Les versions en ligne de Jmol sont représentées par un applet que le navigateur télécharge automatiquement. L'applet Java est assez long à charger, mais il présente une bonne compatibilité avec différents navigateurs et systèmes d'exploitation.

Il exige évidemment le support de Java par la machine cliente. Malheureusement les problèmes de sécurités liés à Java on conduit à l'apparition d'une multitude d'avertissements.

Les logiciels de visualisation moléculaire

Sur des machines bien configurées, l'utilisation d'applets Java provenant de sites de confiance ne doit cependant pas susciter d'inquiétudes. Des solutions plus récentes comme GLmol ou mieux JSmol, la version javascript de Jmol, cherchent à éviter le recours à Java. JSmol sourceforge.

Jmol interactive scripting documentation. Silva N. Marcey D..

Fichiers de molécules

An Introduction to Jmol Scripting. Safari users have to enable WebGL manually. Chime permet de réaliser ces opérations en ligne dans une page web à partir de fichiers.

Après installation de Chime sur votre ordinateur, les liens de la table des matières ci-dessous vous conduisent à des modèles moléculaires tridimensionnels manipulables en ligne. Dans ce site, trois types d'animations sont disponibles selon les molécules : les modèles moléculaires présentés dans une fenêtre Chime sont repérés par l'icône ; certaines macromolécules sont présentées dans une visionneuse 3D dont les commandes sont accessibles par des boutons et sont repérées par l'icône ; d'autres modèles sont présentés dans une animation commandée par un script et sont repérés par l'icône.